Микрокапли решили проблему фосфора в добиологической РНК
Спoнтaннoe присoeдинeниe фoсфoрa к oргaничeским мoлeкулaм термодинамически нет расчета, однако возможно, если процесс происходит не в растворе, а в микрокаплях, показали химики из Стэнфорда. Ученым посчастливилось воссоздать в микрокаплях процессы, которые, возможно, лежали в основе абиогенеза первых молекул РНК — неферментативного фосфорилирования рибозы и образования рибонуклеозида. Разработка опубликована в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.
Фосфорилирование является одной из ключевых реакций в живых клетках. Фосфор входит в состав нуклеиновых кислот (РНК и ДНК), многих липидов в составе клеточной стенки, активность множества внутриклеточных белков регулируется как следует фосфорилирования. В клетках все эти процессы осуществляются при участии ферментов, и чаще всего донором фосфата выступает Аденозинтрифосфат. Однако в водном растворе реакция присоединения фосфата невыгодна с термодинамической точки зрения, поэтому веха включения фосфора в первые органические молекулы остается загадкой для ученых, которые занимаются проблемами происхождения жизни.
Химики из Стэнфорда совместно с корейскими коллегами из института науки и технологии Тэгу-Кёнбук предположили, (как) будто могли появиться первые рибонуклеозиды — компоненты РНК. Именно молекулы РНК, а малограмотный белки, в соответствии с гипотезой РНК-мира, стали первыми биогенными молекулами, способными приводить в исполнение репликацию самих себя и катализ химических реакций.
Ученые смогли осуществить неферментативный единение рибонуклеозида уридинмонофосфата из урацила, рибозы и ортофосфорной кислоты. Ключевым этапом в этой реакции является образование рибозо-1-фосфата, которое в норме безвыгодный идет в водном растворе. Однако авторы работы показали, что эта рефлекс может протекать в микрокаплях.
По всей видимости, на поверхности микрокапель происходит регламентация молекул, которое позволяет ускорить некоторые реакции в миллион раз. Ранее ученым посчастливилось без участия катализатора провести в микрокаплях ряд химических и биохимических реакций, включая окислительно-восстановительные реакции, часть связей между атомами углерода и сворачивание белка.
В эксперименте авторы работы распыляли состав сахара с ортофосфорной кислотой в масс-спектрометре и наблюдали спонтанное появление новых соединений. При комнатной температуре и нормальном давлении таким образом посчастливилось получить значительные количества фосфорилированной рибозы, глюкозы, галактозы и фруктозы. Выход фосфорилированных сахаров в среднем составил десяток процентов от общего количества сахара в растворе. Фосфорилирование всех сахаров происходило ровно по первому атому углерода.
Исследователи рассчитали свободную энергию фосфорилирования рибозы в микрокаплях и показали, какими судьбами ΔG процесса при комнатной температуре составляет −1,1 ккал/моль, то вкушать с точки зрения термодинамики процесс может идти самопроизвольно. Для сравнения, в растворе каста величина больше нуля и составляет 5,4 ккал/моль.
На следующем этапе эксперимента авторы распылили золь, содержащий рибозу, ортофосфорную кислоту и урацил, чтобы продемонстрировать возможность спонтанного синтеза рибонуклеозидов. Выход уридинмонофосфата составил двойка с половиной процента. При этом в микрокаплях, содержащих только рибозу и урацил, химической реакции в лоне ними не происходило.
Выводы исследователей подтверждают гипотезу о том, что реакции абиогенного синтеза в заре зарождения жизни могли происходить в водяных микрокаплях, которые широко распространены в природе (облака, мгла, брызги волн).
Автор: Дарья Спасская